Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF549Q6P9A3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF549Q6P9A3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 940.2 ms