Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TTC41PQ6P2S7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC41PQ6P2S7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms