Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KANK3Q6NY19 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KANK3Q6NY19 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KANK3Q6NY19 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms