Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD54Q6NXT1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms