Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEPROQ6NW34 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms