Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRNP1Q6NT89 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRNP1Q6NT89 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms