Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms