Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFRP4Q6FHJ7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFRP4Q6FHJ7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms