Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF8Q5VWM4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF8Q5VWM4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms