Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BROXQ5VW32 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms