Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC7AQ5VTJ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHDC7AQ5VTJ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHDC7AQ5VTJ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHDC7AQ5VTJ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHDC7AQ5VTJ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC7AQ5VTJ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC7AQ5VTJ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC7AQ5VTJ3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC7AQ5VTJ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC7AQ5VTJ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC7AQ5VTJ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC7AQ5VTJ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC7AQ5VTJ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHDC7AQ5VTJ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHDC7AQ5VTJ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHDC7AQ5VTJ3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms