Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
STRIP1Q5VSL9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
STRIP1Q5VSL9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms