Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms