Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSL3PQ5NE16 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms