Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPANXN3Q5MJ09 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms