Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FGD3Q5JSP0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGD3Q5JSP0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms