Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA3BQ502W6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms