Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GREB1Q4ZG55 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms