Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBW0

NBPF9, Neuroblastoma breakpoint family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF9Q3BBW0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF9Q3BBW0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF9Q3BBW0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF9Q3BBW0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF9Q3BBW0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBPF9Q3BBW0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF9Q3BBW0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF9Q3BBW0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF9Q3BBW0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF9Q3BBW0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBPF9Q3BBW0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF9Q3BBW0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF9Q3BBW0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF9Q3BBW0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF9Q3BBW0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF9Q3BBW0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF9Q3BBW0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF9Q3BBW0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF9Q3BBW0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF9Q3BBW0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBPF9Q3BBW0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF9Q3BBW0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF9Q3BBW0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBPF9Q3BBW0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms