Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX4Q33E94 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms