Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NDUFAF6Q330K2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms