Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KIF4BQ2VIQ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF4BQ2VIQ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF4BQ2VIQ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF4BQ2VIQ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF4BQ2VIQ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIF4BQ2VIQ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF4BQ2VIQ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF4BQ2VIQ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF4BQ2VIQ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms