Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGCAQ16586 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGCAQ16586 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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