Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYPL1Q16563 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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