Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LY6EQ16553 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LY6EQ16553 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms