Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PMCHL1Q16048 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PMCHL1Q16048 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMCHL1Q16048 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMCHL1Q16048 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMCHL1Q16048 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMCHL1Q16048 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms