Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEA2Q15560 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCEA2Q15560 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEA2Q15560 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEA2Q15560 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEA2Q15560 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEA2Q15560 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEA2Q15560 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEA2Q15560 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEA2Q15560 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEA2Q15560 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms