Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH1Q15438 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYTH1Q15438 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYTH1Q15438 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms