Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SF3A2Q15428 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SF3A2Q15428 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SF3A2Q15428 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SF3A2Q15428 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms