Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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PCM1Q15154 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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PCM1Q15154 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
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PCM1Q15154 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCM1Q15154 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCM1Q15154 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCM1Q15154 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCM1Q15154 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCM1Q15154 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCM1Q15154 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCM1Q15154 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCM1Q15154 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCM1Q15154 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCM1Q15154 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCM1Q15154 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCM1Q15154 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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