Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCF4Q15080 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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