Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERV3-1Q14264 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERV3-1Q14264 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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