Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCARB2Q14108 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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