Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP5Q14008 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP5Q14008 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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