Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEF1Q13905 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAPGEF1Q13905 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF1Q13905 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPGEF1Q13905 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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