Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX39BQ13838 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39BQ13838 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms