Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA3CQ13748 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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