Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL4BQ13620 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CUL4BQ13620 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL4BQ13620 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
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