Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LSAMPQ13449 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSAMPQ13449 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSAMPQ13449 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSAMPQ13449 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LSAMPQ13449 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSAMPQ13449 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSAMPQ13449 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSAMPQ13449 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSAMPQ13449 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LSAMPQ13449 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSAMPQ13449 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSAMPQ13449 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSAMPQ13449 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LSAMPQ13449 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LSAMPQ13449 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSAMPQ13449 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LSAMPQ13449 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LSAMPQ13449 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSAMPQ13449 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSAMPQ13449 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSAMPQ13449 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LSAMPQ13449 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSAMPQ13449 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LSAMPQ13449 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LSAMPQ13449 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LSAMPQ13449 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LSAMPQ13449 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LSAMPQ13449 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LSAMPQ13449 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LSAMPQ13449 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LSAMPQ13449 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LSAMPQ13449 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LSAMPQ13449 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LSAMPQ13449 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LSAMPQ13449 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LSAMPQ13449 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LSAMPQ13449 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LSAMPQ13449 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSAMPQ13449 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSAMPQ13449 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSAMPQ13449 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSAMPQ13449 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LSAMPQ13449 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSAMPQ13449 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSAMPQ13449 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LSAMPQ13449 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LSAMPQ13449 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LSAMPQ13449 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSAMPQ13449 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms