Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNTA1Q13424 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNTA1Q13424 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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