Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
IKZF1Q13422 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IKZF1Q13422 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IKZF1Q13422 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms