Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEMA3BQ13214 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA3BQ13214 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3BQ13214 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
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