Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RESTQ13127 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RESTQ13127 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RESTQ13127 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RESTQ13127 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RESTQ13127 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RESTQ13127 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RESTQ13127 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RESTQ13127 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RESTQ13127 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RESTQ13127 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RESTQ13127 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RESTQ13127 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RESTQ13127 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RESTQ13127 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RESTQ13127 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RESTQ13127 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RESTQ13127 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RESTQ13127 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RESTQ13127 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RESTQ13127 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RESTQ13127 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RESTQ13127 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RESTQ13127 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RESTQ13127 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RESTQ13127 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RESTQ13127 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RESTQ13127 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RESTQ13127 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RESTQ13127 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RESTQ13127 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RESTQ13127 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RESTQ13127 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RESTQ13127 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RESTQ13127 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RESTQ13127 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RESTQ13127 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RESTQ13127 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RESTQ13127 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RESTQ13127 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RESTQ13127 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RESTQ13127 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RESTQ13127 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RESTQ13127 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RESTQ13127 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RESTQ13127 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RESTQ13127 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RESTQ13127 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RESTQ13127 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RESTQ13127 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RESTQ13127 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RESTQ13127 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RESTQ13127 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RESTQ13127 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RESTQ13127 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RESTQ13127 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RESTQ13127 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RESTQ13127 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RESTQ13127 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RESTQ13127 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RESTQ13127 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RESTQ13127 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RESTQ13127 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RESTQ13127 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RESTQ13127 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RESTQ13127 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RESTQ13127 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RESTQ13127 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RESTQ13127 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RESTQ13127 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RESTQ13127 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RESTQ13127 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RESTQ13127 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RESTQ13127 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RESTQ13127 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RESTQ13127 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RESTQ13127 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RESTQ13127 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RESTQ13127 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RESTQ13127 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RESTQ13127 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RESTQ13127 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RESTQ13127 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RESTQ13127 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RESTQ13127 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RESTQ13127 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RESTQ13127 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RESTQ13127 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RESTQ13127 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RESTQ13127 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RESTQ13127 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RESTQ13127 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RESTQ13127 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RESTQ13127 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RESTQ13127 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RESTQ13127 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RESTQ13127 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RESTQ13127 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RESTQ13127 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RESTQ13127 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
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