Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ECH1Q13011 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ECH1Q13011 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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