Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TP53BP1Q12888 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TP53BP1Q12888 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TP53BP1Q12888 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TP53BP1Q12888 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TP53BP1Q12888 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TP53BP1Q12888 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TP53BP1Q12888 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TP53BP1Q12888 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TP53BP1Q12888 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TP53BP1Q12888 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TP53BP1Q12888 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TP53BP1Q12888 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TP53BP1Q12888 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TP53BP1Q12888 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms