Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RASGEF1BQ0VAM2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms