Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD47Q08722 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD47Q08722 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD47Q08722 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CD47Q08722 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD47Q08722 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD47Q08722 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD47Q08722 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD47Q08722 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD47Q08722 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD47Q08722 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD47Q08722 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD47Q08722 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD47Q08722 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD47Q08722 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD47Q08722 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD47Q08722 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD47Q08722 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD47Q08722 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD47Q08722 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD47Q08722 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD47Q08722 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD47Q08722 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD47Q08722 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD47Q08722 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CD47Q08722 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD47Q08722 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD47Q08722 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD47Q08722 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CD47Q08722 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD47Q08722 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD47Q08722 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD47Q08722 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD47Q08722 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD47Q08722 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD47Q08722 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD47Q08722 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD47Q08722 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD47Q08722 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD47Q08722 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD47Q08722 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD47Q08722 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD47Q08722 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD47Q08722 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD47Q08722 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD47Q08722 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD47Q08722 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD47Q08722 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD47Q08722 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD47Q08722 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD47Q08722 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD47Q08722 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD47Q08722 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD47Q08722 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD47Q08722 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD47Q08722 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD47Q08722 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD47Q08722 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD47Q08722 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD47Q08722 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD47Q08722 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CD47Q08722 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD47Q08722 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD47Q08722 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD47Q08722 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD47Q08722 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD47Q08722 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD47Q08722 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD47Q08722 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD47Q08722 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD47Q08722 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD47Q08722 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD47Q08722 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CD47Q08722 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD47Q08722 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD47Q08722 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD47Q08722 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD47Q08722 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD47Q08722 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD47Q08722 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD47Q08722 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD47Q08722 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD47Q08722 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD47Q08722 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD47Q08722 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD47Q08722 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD47Q08722 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD47Q08722 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD47Q08722 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD47Q08722 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD47Q08722 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD47Q08722 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD47Q08722 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD47Q08722 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD47Q08722 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD47Q08722 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD47Q08722 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD47Q08722 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD47Q08722 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD47Q08722 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms