Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPN12Q05209 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms