Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC25A11Q02978 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC25A11Q02978 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.2 ms