Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT1Q02742 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT1Q02742 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT1Q02742 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms